1949年2月至1949年8月,冀鲁豫区菏泽师范学校建立。
1949年8月20日平原省建立,冀鲁豫边区菏泽师范学校改为平原省立菏泽师范学校,主管单位平原省教育厅。
1952年12月平原省撤消,菏泽、聊城两地区划入山东省,平原省立菏泽师范学校改称山东省菏泽第一师范学校,简称菏泽一师,由山东省教育厅主管。
1958年7月山东省和菏泽专署为了解决菏泽地区中学师资的困难,决定以菏泽第一师范学校作基础,改建为菏泽师范专科学校。
1962年5月学校传达山东省文教口精简机构会议精神,党委会研究调整撤消工作,6月学校制定了撤消工作计划。1963年11月25日起,该校停止对外办公和一切联系。
1960年建成的东教学楼
1970年7月,山东财经学院被撤销,把人员和学校设备分别搬迁到惠民和菏泽两地,改办惠民、菏泽两处师专,菏泽师范专科学校得以再建。
1978年经国务院批准,菏泽师范专科学校为普通高等师范专科学校
1978年的校园大门
2002年1月7日,经山东省人民政府批准,将菏泽教育学院、菏泽广播电视大学、菏泽农业学校、菏泽师范学校并入菏泽师专,筹建菏泽学院。
2004年5月17日,经教育部批准,菏泽学院成立。
原菏泽农校礼堂
2011年5月,单县师范学校 郓城师范学校并入。
2012年10月,根据省政府要求,菏泽学院实行省市共建、以省为主的管理体制,由省教育厅主管。